• PacBio Hifi ロングリードシーケンス
  • HiFiライブラリ調整、Sequel Ⅱ CCS Sequencing、ヒト用データ解析（SV,CNV）
• バイオインフォマティクス
  • 解析レポート、中間報告、最終報告（手法解説、結果解釈のディスカッション）
  • Circos plot
  • 20サンプル以上の場合、パスウェイエンリッチメント解析

Aコース：トリオのタンデムリピートの探索

• PacBio Hifi ロングリードシーケンス
  • HiFiライブラリ調整、Sequel Ⅱ CCS Sequencing、ヒト用データ解析（SV,CNV）
• バイオインフォマティクス
  • 解析レポート、中間報告、最終報告（手法解説、結果解釈のディスカッション）
  • タンデムリピートの検出
  • 遺伝子アノテーション
  • トリオのタンデムリピート検出結果統合、健常者ー罹患者間で変化の度合いが大きいタンデムリピート探索

Bコース：疾患群共通のタンデムリピートの探索

• PacBio Hifi ロングリードシーケンス
  • HiFiライブラリ調整、Sequel Ⅱ CCS Sequencing、ヒト用データ解析（SV,CNV）
• バイオインフォマティクス
  • 解析レポート、中間報告、最終報告（手法解説、結果解釈のディスカッション）
  • タンデムリピートの検出
  • 遺伝子アノテーション
  • 疾患群のタンデムリピート検出結果統合、健常者ー罹患者間で変化の度合いが大きいタンデムリピート探索

• RNAシーケンス
  • ライブラリ調整、NovaSeq6000による（PolyA 4Gb/13.3Mぺアードリード）によるシーケンシング
• バイオインフォマティクス
  • 解析レポート、中間報告、最終報告（手法解説、結果解釈のディスカッション）
  • 発現定量解析：マッピング、 発現定量、クラスタリング、ヒートマップ、20サンプル以上の場合は主成分分析
  • 二群間解析における発現量比較解析：二群間解析（Volcano plot、４組組み合わせまで）、クラスタリング、ヒートマップ、 主成分分析
  • 発現変動遺伝子の抽出
  • 特定遺伝子に着目した発現量の変化の可視化（Box plotなど）
  • GO解析（Gene Ontology）、パスウェイ解析、20サンプル以上の場合はWGCNA（重み付け遺伝子共発現ネットワーク解析）

Aコース：発現変動遺伝子の群間解析

• シングルセルRNA-seq
  • 10xゲノミクスChroniumコントローラーでのシングルセル化された細胞からのRNA-Seqライブラリー調整、NovaSeq6000による120Gbのシーケンシング、Cell Rangerによる解析
• バイオインフォマティクス
  • 解析レポート、中間報告、最終報告（手法解説、結果解釈のディスカッション）
  • Cell type同定に使用するマーカー遺伝子の検討
  • GO解析（Gene Ontology）、パスウェイ解析

Bコース：細胞分化に関わる発現変動遺伝子解析

• シングルセルRNA-seq
  • 10xゲノミクスChroniumコントローラーでのシングルセル化された細胞からのRNA-Seqライブラリー調整、NovaSeq6000による120Gbのシーケンシング、Cell Rangerによる解析
• バイオインフォマティクス
  • 解析レポート、中間報告、最終報告（手法解説、結果解釈のディスカッション）
  • 疑似系譜解析（Cell trajectoryの推定、マーカー遺伝子の検討）
  • 遺伝子アノテーション
  • GO解析（Gene Ontology）、パスウェイ解析