アメリエフ株式会社

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NGSデータ解析システムのラインナップをリニューアルしました

 アメリエフ株式会社(本社:東京都港区、代表取締役:山口昌雄、以下 アメリエフ)は、これまで各社シーケンサに最適化した解析システムと導入支援、アフターサポートを提供し、ご好評をいただいています。
 この度、弊社独自の解析パイプラインをセットアップした2台構成の高スペックサーバ「NGSデータ解析システム」について、コンサルティング、サポートを充実させリニューアルいたしましたのでお知らせいたします

【背景】
 近年、次世代シーケンサの普及により、オミックス解析によって大量のデータが生み出される時代になり、バイオインフォマティクスが飛躍的に発展しています。
 アメリエフは、データ解析を快適に行うための解析環境、解析を行うための支援、解釈するためのサービスを提供することで、次世代シーケンス技術の活用に貢献してまいりました。この度リニューアルいたしましたNGSデータ解析システムは、多様な解析を複数同時並行かつ高速に実行できる製品となりますので、どうぞこの機会にご検討ください。

【サービス名】
NGSデータ解析システム

【サービスの特徴】

  1. 大容量ストレージサーバにより、最も重要なシーケンスデータ転送・保存のための安定性を確保します。
  2. カスタマイズ可能な高性能解析サーバにより、計算リソースをフル活用した解析が可能です。
  3. サーバーの設置、ネットワーク接続に加え、弊社製パイプラインや、メールサポートコンサルティング、オープンソースソフトウェアのインストール・利用支援など、充実のサポートを提供します。

【メリット】

  1. アメリエフ製パイプライン
    • RNA-seq、Reseqに対応した弊社製パイプラインとそのマニュアル提供、利用方法の解説を行います。
  2. オープンソースソフトウェアサポート
    • ご希望のソフトウェア(最大5本)のインストール、利用方法に関するご相談やシステムトラブルを受け付け、対応いたします。
  3. メールサポートコンサルティング
    • 実施したい解析に適したソフトウェアのご提案と導入方法の解説、解析に必要なデータ加工方法、パラメーター調整、結果の解釈方法など、メールでのコンサルティング(最大月6件)をいたします。

モデル サーバー構成例 特徴 シーケンサ
対応実績
ハイ
スペック
【ストレージサーバ】
CPU: Xeon Silver(20C/2.3GHz) x 2
メモリ: 128GB
SSD: 2TB(OS)
HDD: 18TB×9(RAID6 実効126TB)
ストレージサーバーはシーケンサーからのデータを確実に転送・保存する安定性を確保。
解析サーバーはWES、scRNA解析、ショットガンメタゲノムなど
様々な解析に対応可能なスペックを搭載
しています。
導入ソフトウエア
・アメリエフ製RNA-seqパイプライン
・ご希望のオープンソースソフト5本
Illumina社
NextSeq 550,
NextSeq 2000
システムなど
各種シーケンサ
【解析サーバ】
CPU: Xeon Gold(16C/3.1GHz) x 2
メモリ: 256GB
SSD: 2TB(OS)
HDD: 18TB×9(RAID6 実効126TB)
エンター
プライズ
【ストレージサーバ】
CPU: Xeon Gold(16C/3.1GHz) x 2
メモリ: 256GB
SSD: 2TB(OS)
HDD: 18TB×12(RAID6 実効180TB)
ストレージサーバーでは、高スループットなシーケンサーの出力を受けながらbcl2fastqなどのデータ変換も可能。
ハイスペックな解析サーバーで、scRNA解析、ショットガンメタゲノム等はもちろん
大規模全ゲノムシーケンスへの対応も可能
です。
導入ソフトウエア
・アメリエフ製RNA-seqパイプライン
・アメリエフ製Reseqパイプライン
・ご希望のオープンソースソフト5本

Illumina社
NovaSeq 6000
システムなど
各種シーケンサ

【解析サーバ】
CPU: Xeon Platinum(32C/2.6GHz) x 2
メモリ: 512GB
SSD: 2TB(OS)
HDD: 18TB×12(RAID6 実効180TB)

ご興味のある方は、こちらよりお気軽にご連絡ください。

<お問い合わせ先>
アメリエフ株式会社
コーポレート部門 広報担当
E-mail:pr@amelieff.jp

第68回バイオインフォマティクス勉強会「シングルセルRNA解析入門」

アメリエフは創業当時より「バイオインフォマティクスの活用を促進し研究を加速させる」ミッションを掲げ、定期的にバイオインフォマティクス勉強会を開催しています。
バイオインフォマティクス勉強会は、データが解析されていく様子をバイオインフォマティシャンの目線で体験できるイベントです。
初学者のデータ解析に対する敷居を下げる工夫をしておりますので、エッセンスをお持ち帰りいただきお役立ていただけましたら幸いです。
今回は「シングルセルRNA解析入門」をテーマに開催いたします。

▼オンデマンド動画を視聴する▼

シングルセルRNA-seq解析|NGSケーススタディ講座動画
【講義内容】
新たにシングルセルRNA解析を始める研究者にとって、「自身の研究に最適か」「どのような解析結果が得られるか」がわからないという課題があります。
本セミナーでは、マイクロアレイやバルクRNA解析と比較し、シングルセルRNA解析の特徴を紹介します。また、基本的なデータ解析について、シーケンスデータからクラスタリング、細胞種の同定までを解説します。
シングルセルの活用事例として論文を紹介し、シングルセルRNA解析を導入すべきか否かの判断材料となるようなポイントを解説します。

【こんな方におすすめ】
・シングルセルRNAで何ができるのか関心のある方
・シングルセルRNAのデータ解析を始めたい方
・シングルセルRNAでどのような解析結果が得られるのか知りたい方

勉強会終了後には、実際に解析を行っている技術者との無料相談会を実施いたします。
実験予定があり解析に不安のある方を対象に、完全予約制とさせていただいております。
お申込みの際にご希望をご記入ください。

開催要項

テーマ シングルセルRNA解析入門
講師 アメリエフ株式会社 代表取締役CEO 山口昌雄
日程 2022年7月7日(木)16:00-16:30
場所 オンライン(Zoom)
定員 300名
定員を超えた場合、お申し込みを受け付けられない場合がございます。予めご了承ください。
参加費 無料
申込方法 こちらのフォームよりお申し込みください。
主催 アメリエフ株式会社

皆様のご参加をお待ちしております!

※短時間でエッセンスをつかんでいただくコンセプトでの開催となります。
 内容に、実行環境の準備や解析に必要な全コマンドは含まれませんので、ご了承ください。

新年度RNA-seq受託解析キャンペーン

新年度RNA-seq受託解析キャンペーンのお知らせ

新年度RNA-seq受託解析キャンペーン

ご好評につき期間延長決定!
キャンペーン期間:2022年7月31日 試料またはデータ受領まで

RNA-seq遺伝子発現量群間比較

total RNAからのRNA-seq遺伝子発現量群間比較までワンパッケージでご提供5.9万円/サンプル(4Gb)(税込64,900円)

シーケンスに加えて、論文作成には欠かせない「
二群間解析における発現量比較解析」「
発現変動遺伝子の抽出」「
特定遺伝子に着目した発現量の変化の可視化」「
GO解析」「
パスウェイ解析」込みのスペシャルプラン

RNAseq解析

RNAseq解析とは、次世代シーケンサー(NGS)を用いて転写物の塩基配列を決定する方法です。この配列をリファレンスゲノムへアライメントし、転写産物毎の発現量を測定し、通常はサンプル間の発現量の比較解析を行います。スプライスバリアント毎の発現解析、融合遺伝子検出、変異解析、新たな転写産物の予測を行うことができます。
リファレンスゲノムのない生物の場合でも、配列をアセンブルして転写産物モデルを構築し、アライメントさせて解析することができます。

実験のポイント

解析対象のRNAの種類に適したライブラリー調整キットを用いて、ライブラリー作成を行います。必要なシーケンス量は、生物種や何をプロファイリングしたいかによって異なります。ヒトやマウスの場合、最低でも2000万リード、4Gbp以上の測定が推奨されます。スプライスバリアント(アイソフォーム)の検出や新規転写産物を探索する場合、もしくはFFPEサンプルやnon-conding RNAを扱う場合には、シーケンス量を増やす必要があります。

解析のポイント

NGSによるシーケンスで得られた配列は、FASTQというファイル形式で保存されます。この配列をスプライシングを考慮してゲノム配列にマッピングします。この結果は、BAM形式ファイルで保存され、IGV (Integrative Genomics Viewer)などのゲノムビューワーを用いて閲覧できます。
発現量は、リードカウント、または、補正値を用います。FPKM (Fragments Per Kilobase of exon per Million mapped fragments)やTPM (Transcripts per million)は、発現量をエクソン長と全マッピング数で補正した値です。CPM (Counts per Million mapped reads)は、発現量を全マッピング数で補正した値です。
2群間の比較解析では、発現量の比をlogスケールで表現した値、もしくはt検定による有意差P値がよく用いられます。

研究目的別高次解析のポイント

臨床上の特徴や薬剤が遺伝子発現にどのような影響を及ぼすのかを、発現変動が観測された遺伝子に注目し、特定のパスウェイや生物学的な機能のまとまりで、その意味を捉えることが高次解析の目的です。
このためには以下に示しますように、データの特徴を把握した上で2群間比較による発現変動遺伝子解析を行い、その上で研究目的に応じた生物学的な機能を理解するための解析手法を適切に選択することが重要となります。

データの特徴の把握

・主成分分析

主成分分析

 全サンプルを対象に、遺伝子発現の傾向を二次元プロットで表現します。これにより、二次元上にプロットされた各サンプル間の距離から、類似性を読み取ることができます。複数サンプルの発現プロファイルの類似度を視覚化し、その後の解析で群間の差を見出すことができるデータであることを確認します。 主成分分析

・階層的クラスタリングのヒートマップ

階層的クラスタリングのヒートマップ

 縦軸に遺伝子、横軸にサンプルを配置し、発現量を色で表現します。
各軸でクラスタリングを実施し、群ごとに同じまたは近いクラスタに分類します。はずれ値を持つサンプルを確認できます。
階層的クラスタリングのヒートマップ

2群間比較による発現変動遺伝子解析

2群間で有意に発現量に差がある遺伝子群を特定します。

・Volcano plot

Volcano plot

 2群間の比較解析において、有意差P値(logスケール)と発現量の比(logスケール)を2次元プロットで表現します。各プロットの点は遺伝子に該当し、有意に変動している(p値や発現量比)遺伝子数の概観の確認や、変動の傾向の把握に使用します。
各点に該当する遺伝子名を重ねて表記するなどし、既知の遺伝子で想定される発現変動が起きているかを確認するなど、データの妥当性の検討に用います。
Volcano plot

発現変動遺伝子と生物学的意義

発現変動した遺伝子群の生物学的機能の共通点や、影響を受けているパスウェイ等の探索を行います

・GO(Gene Ontology)解析

GO解析

 Gene Ontologyとは、遺伝子の属性を説明する語彙を体系化・構造化した記述方法です。GOは生物学的プロセス、細胞の構成要素、分子機能の3カテゴリーに分けることができ、それぞれのカテゴリーにはさらなる下位概念が定義されています。有意に変動した遺伝子群がどのような生物学的概念にエンリッチしているかを解析することで、比較対象が影響を与えている生物学的機能を捉えます。
最上位GOから、下位GOまでの繋がりを図に示します。それぞれのGOのエンリッチメント解析結果は色の濃淡で有意差(P値)の大きさを表します。
GO解析

アメリエフが選ばれる理由

  • ・実験と解析をワンパッケージでご提供します
  • ・研究目的にあった解析手法を選択し解析プランを組み立てます
  • ・解析内容と解析結果を丁寧にご説明し仮説検証に貢献します

解析メニュー

  • RNAシーケンス
    • ライブラリ調製、NovaSeq6000による(PolyA 4Gb/13.3Mぺアードリード)によるシーケンシング
    • バイオインフォマティクス

    • 解析レポート、中間報告、最終報告(手法解説、結果解釈のディスカッション)
    • 発現定量解析:マッピング、 発現定量、クラスタリング、ヒートマップ、20サンプル以上の場合は主成分分析
    • 二群間解析における発現量比較解析:二群間解析(Volcano plot、4組組み合わせまで)、クラスタリング、ヒートマップ、 主成分分析
    • 発現変動遺伝子の抽出
    • 特定遺伝子に着目した発現量の変化の可視化(Box plotなど)
    • GO解析(Gene Ontology)、パスウェイ解析、20サンプル以上の場合はWGCNA(重み付け遺伝子共発現ネットワーク解析)
  • ※non stranded RNA-seqとなります。strand specific RNA-seqをご希望の場合はお問合せください
  • ※12Gbの場合(NovaSeq6000によるPolyA 12Gb/40Mぺアードリード)、6.9万円/サンプル(税込75,900円)となります。

サンプルに関して

サンプル要件

  • RNA-seq遺伝子発現量群間比較
    • サンプルタイプ:total RNA
      ※サンプルQCでRIN値が非常に低い場合は、再提出をお願いすることがございます。
      ※ ヒトおよびマウス以外の生物種をご希望の場合は、お問合せください。

      総量(µg) 液量(µL) 濃度(µg) 純度
      1以上 20以上 50以上 OD260/280 1.8 - 2.2
      OD260/230 ≧ 1.8

送付方法

サンプルは、ドライアイス同梱の上、ノボジーン東京配送センターにお送りください。

 〒103-0023  東京都中央区日本橋本町2-3-11
日本橋ライフサイエンスビルB101 東京配送センター

注意事項

  • ※シーケンスデータはノボジーン株式会社が提供いたします
  • ※東京配送センター利用料金、データ納品のHDD/Cloudの費用は別途頂戴いたします。
  • ※シングルセル遺伝子発現解析は、機器を持ち込んでの出張サービスも承っております。
    その際には出張費をご請求いたします。
    また、ノボジーンラボにサンプルを持ち込んで頂いてのご利用も可能です。詳細はお問合せください。
新年度シングルセルRNA-seq受託解析キャンペーン

新年度シングルセルRNA-seq受託解析キャンペーンのお知らせ

新年度シングルセルRNA-seq受託解析キャンペーン

ご好評につき期間延長決定!
キャンペーン期間:2022年7月31日 試料またはデータ受領まで

シングルセルRNA-seq発現変動遺伝子解析

シングルセル化した細胞からのシングルセルRNA-seq発現変動遺伝子解析までワンパッケージでご提供110万円/サンプル(税込1,210,000円)

シーケンスに加えて、論文作成には欠かせない「
Cell type同定に使用するマーカー遺伝子の検討」または「
疑似系譜解析」「
GO解析」「
パスウェイ解析」込みのスペシャルプラン

シングルセルRNAseq解析

シングルセルRNAseqとは、細胞の遺伝子発現プロファイルを一細胞レベルで取得して観測する画期的な技術です。これまでのRNAseq解析では、観測対象が細胞集団であり、細胞集団における各遺伝子の"平均的な"遺伝子発現を測定していました。一方、scRNAseqは細胞集団内の個々のトランスクリプトームを捉え、細胞特異的な変化を同定することが可能になります。Science誌において2018年のBreakthrough of the Yearとしても選出された技術であり、近年盛んに研究に用いられています。

実験のポイント

シングルセルRNAseqでは、細胞の生存率が非常に重要です。
死細胞が溶解すると周囲にRNAが遊離し、分析時のバックグラウンドノイズの一因となり、シングルセルデータの品質を著しく低下させるため、細胞の生存率を高める必要があります。一般的には生存率90%以上が推奨され、クリアな解析結果を得るためには、80%程度以上の生存率が必要です。
またライブラリ調整に際しては、細胞数が106以上であること、細胞サイズが直径 30μm以下であること、細胞を分離させておくことなどの条件をクリアする必要があります。

解析のポイント

特定の細胞種ごとの遺伝子発現プロファイルを確認します。まず、データのクオリティを確認した上で、細胞をクラスタリングし、各クラスターごとに遺伝子発現の状態を把握するための一連の解析を行います。

高次解析により得られる図表の例

バイオリンプロット、クラスタリング結果、Feature plot、UMAP

研究事例

1)がん組織の不均一性における薬物耐性の発生機序解明に関する研究

  •  薬物耐性獲得のメカニズムの解明は、がんの薬物治療において不可欠な要素です。耐性獲得の背景は、様々あるとされていますが、がん組織の不均一性がその原因の一つであると考えられています。Kashimaらは、がん組織の不均一性における薬物耐性の発生機序解明にscRNAseq解析を利用しました(Kashima et al., Cancer Res, 2021)。
  •  具体的には、オシメルチニブ耐性細胞の出現機構を解明するために、EGFR遺伝子に変異をもつヒト肺腺がん細胞株であるNCI-H1975細胞を用いて一細胞解析を行いました。H1975はオシメルチニブ感受性の細胞であることが知られていますが、この細胞を段階的にオシメルチニブに曝露し、各段階での細胞群をscRNAseq解析することで、①親株に少数のオシメルチニブ耐性細胞が存在すること、②オシメルチニブ曝露群にしか出現しない細胞群が存在すること、が明らかになりました。

2)発生/分化分野での毛包形成研究

  •  全世界で男性の50%、女性の25%が薄毛に悩んでいると言われており、自己由来の幹細胞から毛包を誘導する研究が注目されています。しかし、生体内での毛包のde novo形態形成については、毛包の不均一性や非同期的な発達のため、アプローチが難しく理解が進まない状態でした。このような観点から、毛包のde novo形態形成の基礎となる分子経路を明らかにすることは、毛包の発生に関する深い洞察をもたらし、in vitro条件下での毛包の発生を誘導する上で重要な意味を持つと考えられます。
  •  GeらはscRNAseq技術を用いて、様々な分化期におけるマウス背部皮膚から得られた細胞群に対して一細胞のトランスクリプトームを統合的に解析しました(Ge et al., Theranostics, 2020)。その結果、9つの主要な細胞集団の同定と、上皮/真皮細胞系の分化の軌跡を構築することに成功し、細胞の運命決定に関わる主要なレギュロンが順次活性化されていることを明らかにしました。

アメリエフが選ばれる理由

  • ・実験と解析をワンパッケージでご提供します
  • ・研究目的にあった解析手法を選択し解析プランを組み立てます
  • ・解析内容と解析結果を丁寧にご説明し仮説検証に貢献します

解析メニュー

Aコース:発現変動遺伝子の群間解析

  • シングルセルRNA-seq
    • 10xゲノミクスChroniumコントローラーでのシングルセル化された細胞からのRNA-Seqライブラリー調製、NovaSeq6000による120Gbのシーケンシング、Cell Rangerによる解析
    • バイオインフォマティクス

    • 解析レポート、中間報告、最終報告(手法解説、結果解釈のディスカッション)
    • Cell type同定に使用するマーカー遺伝子の検討
    • GO解析(Gene Ontology)、パスウェイ解析

Bコース:細胞分化に関わる発現変動遺伝子解析

  • シングルセルRNA-seq
    • 10xゲノミクスChroniumコントローラーでのシングルセル化された細胞からのRNA-Seqライブラリー調製、NovaSeq6000による120Gbのシーケンシング、Cell Rangerによる解析
    • バイオインフォマティクス

    • 解析レポート、中間報告、最終報告(手法解説、結果解釈のディスカッション)
    • 疑似系譜解析(Cell trajectoryの推定、マーカー遺伝子の検討)
    • 遺伝子アノテーション
    • GO解析(Gene Ontology)、パスウェイ解析

サンプルに関して

サンプル要件

  • シングルセルRNA-seq発現変動遺伝子解析
    • サンプルタイプ:細胞
      ※ ヒトおよびマウス以外の生物種をご希望の場合は、お問合せください。

      • 凍結状態であること。
      • 細胞数は106細胞以上であること。
      • 融解後の細胞の生存率が90%以上推奨。
      • 細胞は分散もしくは単離してください。
      • EDTA0.1mM以下、マグネシウム3mM以下、界面活性剤は含まないこと。
      • 細胞サイズが直径30μm以下であること。
      • 40μmのフィルターにかけてください。
      • 凍結の際にはセルバンカー等を用いてください。

送付方法

サンプルは、ドライアイス同梱の上、ノボジーン東京配送センターにお送りください。

 〒103-0023  東京都中央区日本橋本町2-3-11
日本橋ライフサイエンスビルB101 東京配送センター

注意事項

  • ※シーケンスデータはノボジーン株式会社が提供いたします
  • ※東京配送センター利用料金、データ納品のHDD/Cloudの費用は別途頂戴いたします。
  • ※シングルセル遺伝子発現解析は、機器を持ち込んでの出張サービスも承っております。
    その際には出張費をご請求いたします。
    また、ノボジーンラボにサンプルを持ち込んで頂いてのご利用も可能です。詳細はお問合せください。
第67回バイオインフォマティクス勉強会「シングルセルRNA解析のサンプル統合解析とvelocity解析@録画配信」

アメリエフは創業当時より「バイオインフォマティクスの活用を促進し研究を加速させる」ミッションを掲げ、定期的にバイオインフォマティクス勉強会を開催しています。
バイオインフォマティクス勉強会は、データが解析されていく様子をバイオインフォマティシャンの目線で体験できるイベントです。
初学者のデータ解析に対する敷居を下げる工夫をしておりますので、エッセンスをお持ち帰りいただきお役立ていただけましたら幸いです。
今回は「シングルセルRNA解析のサンプル統合解析とvelocity解析」をテーマに開催いたします。

▼オンデマンド動画を視聴する▼

シングルセルRNAにおけるサンプル統合解析と疑似系譜解析動画
【講義内容】
シングルセルRNA-seqによる転写産物の発現量の定量や精度、群間比較の方法についてご説明します。
また、シングルセル解析パッケージSeuratを用いた複数サンプルのシングルセルRNAの統合解析や、RNA velocity解析などの発展的な解析ワークフローについてもご紹介。
シングルセルRNA-seqを始めたい、データ解析の統計的な意味を知りたい、外注先から結果を受け取った後の目途を立てたいといったお悩みを解消します。
※今回は2022年4月27日に実施した勉強会の録画配信となります。

【こんな方におすすめ】
・シングルセルRNA-seqのデータ解析を始めたい方
・発現情報をもとに薬剤応答の解析をすすめたい方
・細胞分化に注目した時系列での解析を行いたい方

勉強会終了後には、実際に解析を行っている技術者との無料相談会を実施いたします。
実験予定があり解析に不安のある方を対象に、完全予約制とさせていただいております。
お申込みの際にご希望をご記入ください。

開催要項

テーマ シングルセルRNA解析のサンプル統合解析とvelocity解析
講師 アメリエフ株式会社 代表取締役CEO 山口昌雄
日程 2022年6月29日(水)17:00-17:30
場所 オンライン(Zoom)
定員 300名
定員を超えた場合、お申し込みを受け付けられない場合がございます。予めご了承ください。
参加費 無料
申込締切 2022年6月29日(水)12:00
主催 アメリエフ株式会社

皆様のご参加をお待ちしております!

※短時間でエッセンスをつかんでいただくコンセプトでの開催となります。
 内容に、実行環境の準備や解析に必要な全コマンドは含まれませんので、ご了承ください。

第66回バイオインフォマティクス勉強会「遺伝情報活用のためのGWAS@オンライン」

アメリエフは創業当時より「バイオインフォマティクスの活用を促進し研究を加速させる」ミッションを掲げ、定期的にバイオインフォマティクス勉強会を開催しています。
バイオインフォマティクス勉強会は、データが解析されていく様子をバイオインフォマティシャンの目線で体験できるイベントです。
初学者のデータ解析に対する敷居を下げる工夫をしておりますので、エッセンスをお持ち帰りいただきお役立ていただけましたら幸いです。
今回は「遺伝情報活用のためのGWAS」をテーマに開催いたします。

▼オンデマンド動画を視聴する▼

遺伝情報活用のためのGWAS解析動画
【講義内容】
GWAS(ゲノムワイド関連解析)は、疾患に関連する遺伝的変異を網羅的に探索することを目的とした、20年以上の実績がある信頼性の高い研究手法です。
近年、遺伝統計学の進展により、多因子疾患の遺伝的リスクを評価するポリジェニックリスクスコアが注目され、疾患リスクの予測精度の向上が期待されています。
本勉強会では、GWASの基本的な考え方からデータ解析手法まで解説します。また、ポリジェニックスコアや遺伝子型インピュテーションのエッセンスをご紹介します。

 

【こんな方におすすめ】
・GWASの手法や活用方法に関心のある方
・疾患原因遺伝子の探索に取り組んでいる方
・薬剤応答に関わる遺伝子探索に興味のある方

勉強会終了後には、実際に解析を行っている技術者との無料相談会を実施いたします。
無料相談のご要望が多いため、初めてご相談される方のみの、完全予約制とさせていただいております。
お申込みの際にご希望の相談内容をご記入ください。

開催要項

テーマ 遺伝情報活用のためのGWAS
講師 アメリエフ株式会社 代表取締役CEO 山口昌雄
日程 2022年6月29日(水)16:00-16:30
場所 オンライン(Zoom)
定員 300名
定員を超えた場合、お申し込みを受け付けられない場合がございます。予めご了承ください。
参加費 無料
申込締切 2022年6月29日(水)12:00
主催 アメリエフ株式会社

皆様のご参加をお待ちしております!

※短時間でエッセンスをつかんでいただくコンセプトでの開催となります。
 内容に、実行環境の準備や解析に必要な全コマンドは含まれませんので、ご了承ください。

「最新のDNBSEQ™活用事例とバイオインフォマティクス」セミナー|MGI Tech Japan株式会社×PHC株式会社

「最新のDNBSEQ™活用事例とバイオインフォマティクス」セミナー

概要

 近年、診断・治療を目的としたゲノム医療の普及に向けて、国をあげた取組みが推進されています。これらの取り組みには、次世代シーケンサーを活用した最先端のゲノム解析技術の応用ツールが必要とされるだけでなく、遺伝子情報の高精度なデータ解析を、より効率的且つ経済的に実現するソリューションが求められています。
 このたびPHC株式会社 バイオメディカ事業部では中国MGI Tech社製次世代シーケンサーを研究者の皆様向けに販売を開始しました。さらにPHCグループのアメリエフ株式会社ではMGI社製次世代シーケンサー向けの解析パイプラインを開発し、あらゆる研究ニーズに対応した包括的なソリューションをご提供します。
 本セミナーにおいては、MGI社のNGS、「DNBSEQシリーズ」とDNBSEQを用いた論文をご紹介させていただきます。また、NGSを初めて実施する方向けに、お客様の研究目的ごとの結果を見据えた最適なバイオインフォマティクス環境のご提案と、データ解析事例を紹介いたします。

2021/12/08開催「DNBSEQ™で始める次世代DNAシーケンス」セミナー ダイジェスト動画

【こんな方におすすめ】
・次世代シーケンサーを所有されている方
・DNBSEQ™に興味をお持ちの方
・バイオインフォマティクス解析の最新事例を知りたい方

プログラム

16:00~16:05 開会のご挨拶
PHC株式会社
16:05~16:25 DNBSEQ™ Technologyを用いた製品紹介と活用事例
MGI Tech Japan株式会社

DNBSEQ™によりNGSの選択肢が増える可能性を、具体的なアプリケーション例と共にご紹介します。
16:25~16:40 バイオインフォマティクス環境構築とデータ解析事例
アメリエフ株式会社 代表取締役社長 山口昌雄

NGSの活用目的に沿ったバイオインフォマティクス環境と、データ解析事例をご紹介します。
16:40~16:50 質疑応答、閉会のご挨拶
PHC株式会社

開催要項

日程 2022年6月23日(木) 16:00〜17:00
配信方法 Zoomウェビナー ※前日までに参加用URLをお知らせいたします。
定員 500名
参加費 無料
申込方法 お申し込みは締め切りました。
申込締切 2022年6月22日(水) 12:00
主催 PHC株式会社 バイオメディカ事業部

NGS解析に関して、担当による無料相談を希望しますか?

セミナー終了後には、実際に解析を行っている技術者との無料相談会を実施いたします。
無料相談のご要望が多いため、初めてご相談される方のみの、完全予約制とさせていただいております。
お申込みの際にご希望の相談内容をご記入ください。

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