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RNA-seq解析|WET&DRY
RNA-seq WET&DRY【受託解析キャンペーン】

論文作成には欠かせない
Gene Ontology解析
パスウェイ解析

まで込みのスペシャルプライス

2.0万円/サンプル(税抜)
※DNBSEQ™、polyA選択、4Gb、基礎解析プランの場合の価格、詳細は価格表をご参照ください

サービス内容

【WET】RNAシーケンス
○ ライブラリ調製
○ Illumina社 NovaSeq™ X Plus / MGI社 DNBSEQ™ によるシーケンシング(PolyA、150PE)
【DRY】データ解析(基礎解析プラン)
○ 発現定量解析:マッピング、発現定量、階層的クラスタリング (ヒートマップ描画)、 主成分分析
○ 二群間の発現量比較解析(サンプル数によって組み合わせ数を決定):Volcano plot
○ エンリッチメント解析:Gene Ontology解析、Reactomeパスウェイ解析
○ 解析レポート、結果データ一式の納品

サンプル要件 / 注意事項

サンプルタイプ:total RNA

総量(ng) 液量(µL) 濃度(ng/µL) RIN値 純度
200以上 10以上 20以上 4.0以上
with flat base line
OD260/280 = 1.8-2.2
OD260/230 ≥ 1.8
no degradation,
no contamination
  • ※ サンプルQCでRNA総量またはRIN値が非常に低い場合は、再提出をお願いすることがございます
    (再提出1回まで無償対応)
  • ※ シーケンシングは日本(NovaSeq™:真核生物のみ)またはシンガポール・中国にて実施します
  • ※ 対応生物種:ヒト・マウス・ラット
    その他の生物種はご相談ください
  • ※ RNA抽出からご依頼時のサンプル要件: 分離細胞1.0×105 細胞以上、組織切片10-30 mg
  • ※ DRY(データ解析)のみの場合、FASTQファイル(生データ)から受付いたします

データ解析内容

解析結果

価格表(税抜)

製品名 単価(税抜)
DNBSEQ™(polyA選択、4Gb) 2.0万円/サンプル
NovaSeq™(ストランド特異的、polyA選択、6Gb) 2.7万円/サンプル
NovaSeq™(ストランド特異的、polyA選択、9Gb) 3.0万円/サンプル
データ解析のみ 1.0万円/サンプル
選べるデータ解析プラン
秋の受託解析キャンペーン

【受託解析キャンペーン】

キャンペーン期間:2025年10月6日(月)~2026年3月18日(水) サンプル受領まで

「データ解析込み」でこの価格、更にボリュームディスカウントも対応

RNA-seq解析 基礎解析プラン(GO解析、パスウェイ解析まで)
製品名 単価(税抜)
DNBSEQ™(polyA選択、4Gb) 2.0万円/サンプル
NovaSeq™(ストランド特異的、polyA選択、6Gb) 2.7万円/サンプル
NovaSeq™(ストランド特異的、polyA選択、9Gb) 3.0万円/サンプル
データ解析のみ 1.0万円/サンプル
シングルセル解析 基礎解析プラン(GO解析、パスウェイ解析まで)
製品名 単価(税抜)
シングルセル遺伝子発現Flex 180万円/4サンプル
シングルセルRNA-seq解析 62万円/サンプル
データ解析のみ 14万円/サンプル
空間的遺伝子発現解析
製品名 単価(税抜)
Trekker™
【真のシングルセル(核)解像度|全ての真核生物に対応可能|全遺伝子を検出可能】
320万円/2サンプル
Xenium 5K 500万円/2サンプル
Visium HD 280万円/2サンプル
データ解析のみ 43万円/サンプル
がん変異解析
製品名 単価(税抜)
WESがん変異解析(Agilent SureSelect V6, 正常組織 6Gb, 腫瘍組織 12Gb) 11.5万円/症例(1ペア)
WGSがん変異解析(NovaSeq™ X, 正常組織 90Gb, 腫瘍組織 90Gb) 39.0万円/症例(1ペア)
遺伝性変異解析
製品名 単価(税抜)
WES遺伝性変異解析(Agilent SureSelect V6, 6Gb) 7.3万円/サンプル
WGS遺伝性変異解析(NovaSeq™ X, 90Gb) 19.5万円 / サンプル

キャンペーン対象のデータ受託解析メニュー

選べるデータ解析プラン

基礎解析プラン

解析名 解析内容
RNA-seq解析 発現定量解析、 二群間比較解析、 エンリッチメント解析
シングルセル解析 クオリティコントロール、 データ統合、 クラスタリング、 クラスタごとの特徴遺伝子の探索、 発現量可視化、 二群間比較解析、 エンリッチメント解析

標準解析プラン

選べるデータ解析プラン

報告会とアフターサポート【データ解析者の視点で研究支援】
・レポート:経験豊富な解析担当者が研究目的を踏まえた所感を添えたレポートを提供します。
・報告会:解析結果の解釈に関して解析担当者からの報告とディスカッションを行います。
・アフターサポート:報告会後 1ヵ月間、メールでのQA対応や図の調整を行います。

解析名 解析内容
RNA-seq解析 発現定量解析、 二群間比較解析、 エンリッチメント解析
シングルセル解析 クオリティコントロール、 データ統合、 クラスタリング、 クラスタごとの特徴遺伝子の探索、 発現量可視化、 二群間比較解析、 エンリッチメント解析、 特定クラスタに着目した解析(再次元削減、サブクラスタリング、二群間比較、擬似系譜解析)
空間的遺伝子発現解析 クオリティコントロール、 データ統合、 クラスタリング、 クラスタごとの特徴遺伝子の探索、 発現量可視化、 二群間比較解析、 エンリッチメント解析、 特定クラスタ、座標に着目した解析(再次元削減、サブクラスタリング、二群間比較、擬似系譜解析)
がん変異解析 がん変異の検出、 De novo mutation signature 解析、 Oncoplot、 新規Driver gene候補推定
遺伝性変異解析 アノテーション、 遺伝形式による変異の抽出

▼データ解析の専門家による報告会の様子をご覧ください▼

コンサルティングプラン

【専門家チームと密に協議し研究目的に応じたデータ解析を実現】
・研究テーマとゴールを共有し、解析計画を策定し提案します。
・2~3週間のサイクルで協議を重ね、常に計画を最適化しながら柔軟に解析を進めます。

  ・議論を繰り返しながら、目的に応じた最適な解析方法を提案、実施します。
・解析途中で生じた課題に対して、解決方法を提案、実施します。
・High impact な論文にも耐えうる水準のレポートを提供します。

 ※ 本ページに記載されている会社名および商品名などは、各社の商号、または登録済みもしくは未登録の商標であり、これらは各所有者に帰属します。
バイオインフォマティクス・トレーニングキャンペーン

【受託解析キャンペーン】

キャンペーン期間:2025年5月20日(火)~2025年7月31日(木)

体系的に学べる

目標となる解析技術を身に付けるため基礎から体系的に学習できるカリキュラム

体系的に学べる

実践的なコマンド実習

動画学習とサーバ実習を通して段階的に学びを深め自分のペースで実践的に学習

実践的なコマンド実習

プロに質問できる

現役バイオインフォマティシャンに質問できるWeb会議形式のハンズオン質問会

プロに質問できる

基礎2科目(Linux+R)+応用1科目(RNA-seq解析・シングルセルRNA-seq解析・空間的遺伝子発現解析から選択)の、お得な価格で体系的な学びをご提供する「スタンダードコース」新登場。バイオインフォマティクス初学者の方も、標準的な解析手法を自分で実行できるようになります。

対象期間 2025年5月20日(火)~2025年7月31日(木)
キャンペーン対象 スタンダードコース(希望小売価格から10%OFF)
実施形式 オンライン
注意事項 訪問・同時双方向型トレーニング、オンデマンド実習プラン(単科目)は対象外

スタンダードコース詳細

コース 内容 キャンペーン価格
RNA-seq解析 Linux、R、RNA-seq解析(動画視聴+サーバ実習)
ハンズオン質問会(科目毎1回)
18万円/名(税抜)
シングルセルRNA-seq解析 Linux、R、シングルセルRNA-seq解析(動画視聴+サーバ実習)
ハンズオン質問会(科目毎1回)
21.6万円/名(税抜)
空間的遺伝子発現解析 Linux、R、空間的遺伝子発現解析(動画視聴+サーバ実習)
ハンズオン質問会(科目毎1回)
27万円/名(税抜)
※学習期間(動画視聴+サーバ実習+ハンズオン質問会)は8週間となります。
※ハンズオン質問会は各科目別に月1回(固定日)、参加者を限定せずに開催いたします。
※日程調整可能なマンツーマンでの個別レッスンの追加やオンデマンド実習の延長も、別途有償で可能です。詳細はお問合せください。

科目詳細

科目 科目詳細 標準学習時間 サンプル
Linux

・Linuxの概要

・ディレクトリ構造、ファイルやディレクトリの作成・コピー・移動・削除、絶対パスと相対パス、アクセス権限、ファイル内容の加工

・ソフトウェアのダウンロード・インストール

300分
(動画48分)
R

・起動・終了、基本的演算(四則計算など)、変数の取り扱い、オブジェクトの取り扱い、ベクトル・リスト・マトリクス・データフレームの取り扱い

・基本統計量の計算、作図

・パッケージのインストール・読み込み

300分
(動画74分)
RNA-seq解析

・NGS基礎知識と主なファイル形式

・公開データの取得方法

・RNA-seq解析:クオリティチェックとクオリティコントロール、マッピング、発現定量、正規化、発現変動遺伝子の検出、結果の可視化、発現定量と発現比較、GOエンリッチメント解析、パスウェイエンリッチメント解析

360分
(動画74分)
シングルセル
RNA-seq解析

・シングルセルRNA-seq解析基礎知識と解析の流れ

・Seuratを用いた解析:データの読み込み、クオリティコントロール、正規化、フィルタリング、データのスケーリングとノイズの除去、次元削減、下流解析で使用する主成分軸数の決定、クラスタリングと結果の可視化、マーカー遺伝子探索、統合解析

420分
(動画60分)
空間的
遺伝子発現解析

・空間的遺伝子発現解析基礎知識と解析の流れ

・Seuratを用いた解析:クオリティコントロール・正規化、次元削減・クラスタリング・細胞のプロット、マーカー遺伝子探索・発現量の視覚化、空間座標の抽出、データ統合、GOエンリッチメント解析

480分
(動画144分)

受講イメージ

受講イメージ

春の受託解析キャンペーン

【受託解析キャンペーン】

キャンペーン期間:2025年4月14日(月)~7月9日(水) サンプル受領まで

「WET実験+DRY解析+報告会+アフターフォロー」セットでこの価格!

代表的な価格一覧 代表的な価格一覧

アメリエフの受託解析の特徴

お得な料金プラン

  一般に提供されている「WET実験+基礎解析」の価格で、高度な解析とアフターフォローまで提供
高度な解析として、二群間比較、GO、パスウェイ解析を提供

研究内容を踏まえた報告会

  データ解析手法から解釈まで丁寧にご説明
データ解析の専門家による見解を踏まえたディスカッション

安心のアフターフォロー

  報告会後1ヶ月間、Q&Aをメールにて回答
学会発表や論文投稿のための、Figureの微修正にも対応

▼データ解析の専門家による報告会の様子をご覧ください▼

価格表(税抜)

製品名 WET
実験
DRY
解析
報告会 単価(税抜)
RNA-seq
解析
Novaseq™、polyA選択、4Gb 〇 〇 1回 3.9万円/サンプル
DNBSEQ™、ストランド特異的、polyA選択、6Gb 〇 〇 1回 4.2万円/サンプル
Novaseq™、ストランド特異的、polyA選択、6Gb 〇 〇 1回 4.4万円/サンプル
データ解析のみ - 〇 1回 2.8万円/サンプル
シングル
セル
解析
シングルセル遺伝子発現Flex 〇 〇 2回 260万円/4サンプル
シングルセルRNA-seq解析 〇 〇 2回 74万円/サンプル
データ解析のみ - 〇 2回 28万円/サンプル
空間的
遺伝子発現
解析
Xenium 5K 〇 〇 2回 530万円/2サンプル
Visium HD 〇 〇 2回 340万円/2サンプル
Stereo-seq™ 〇 〇 2回 212万円/サンプル
データ解析のみ - 〇 2回 43万円/サンプル
エピゲノム
解析
ATAC-seq 〇 〇 1回 16.9万円/サンプル
ChIP-seq 〇 〇 1回 16.9万円/サンプル
CUT&RUN-seq 〇 〇 1回 16.9万円/サンプル
データ解析のみ - 〇 1回 13.3万円/サンプル

※RNA-seq解析は6サンプル以上の場合の価格、6サンプル未満でも6サンプル分の費用がかかります。20サンプル以上でボリュームディスカウントが可能です。RNA抽出からも対応可能です。(+1.5万円/サンプル)

※シングルセルRNA-seqは4サンプル以上、Flexは8サンプル以上でボリュームディスカウントが可能です。

※空間的遺伝子発現解析では、XeniumとVisium HDは4サンプル以上、Stereo-seqは2サンプル以上でボリュームディスカウントが可能です。プラットフォームは上記以外のXenium 1KやCosMx™なども対応可能です。

※エピゲノム解析は3サンプル以上の場合の価格、3サンプル未満でも3サンプル分の費用がかかります。10サンプル以上でボリュームディスカウントが可能です。

ご利用の流れ

ご利用の流れ(WET&DRY)

  • 研究目的、サンプル情報をヒアリングし、お見積りを作成します。
  • ご発注後、サンプルを準備いただき、シーケンスを行います。
  • 報告会にて、高次解析結果の報告および解釈について、ご報告します。
バイオインフォマティクス・トレーニング「新科目リリースキャンペーン」
バイオインフォマティクス・トレーニング「新科目リリースキャンペーン」

【新科目】  エッセンシャル動画視聴プラン

 大学・研究所の医師や研究者、企業の研究職のみなさまの独学を支援するための新プラン「エッセンシャル動画視聴プラン」をリリースいたしました。
 データ解析に役立つLinuxとRの基礎知識と活用イメージを学び、今後の研究推進に必要な技術か検討できます。

受講イメージ

入門のためのエッセンシャル動画視聴プランから、
実践のオンデマンド実習プランへ、習熟度に合わせて学習を進められます。

<オンデマンド実習プラン>


◆すぐにコマンドを実践できる
インターネット環境さえあれば、すぐにトレーニング用解析環境をご提供。
コマンド理解とサーバ実習のセットで段階的に学びを深め バイオインフォマティクスを実践できます。

◆現役バイオインフォマティシャンに質問できる
トレーニング内容のわからないこと、上手くいかないコマンドを 実際にデータ解析をしている現役バイオインフォマティシャンにハンズオン形式で質問できます。

トレーニングオンデマンド受講のイメージ

キャンペーン詳細

オンデマンド実習プラン追加お申込みすれば
Linux & R エッセンシャル動画視聴プラン
実質無料!

対象期間 2025年1月27日(月)~2月28日(金)
キャンペーン対象 対象期間内にLinux & R エッセンシャル動画視聴プランをご発注された方
実施形式 オンデマンドサイトでの受講
注意事項 Linux & R エッセンシャル動画視聴プランのご発注日より、3ヶ月以内にオンデマンド実習プランにお申込みいただくと、1科目のみ5,000円割引(税抜)でご提供いたします。

Linux & R エッセンシャル動画視聴プランをクレジットカードまたは銀行振込で購入希望の方は、上記「Linux & Rご購入はこちら」ボタンよりお進みください。ご購入には、弊社学習サイト「バイオインフォマティクス・トレーニングオンデマンド」への会員登録が必要です。

▼トレーニングオンデマンドの体験動画をご視聴ください!▼

プラン詳細

<エッセンシャル動画視聴プラン>

科目 学習内容 学習方式 価格(税抜)
Linux ・Linuxの概要、ディレクトリ構造、絶対パスと相対パス
・ディレクトリ移動、ファイル操作・加工などの15コマンド
・ソフトウェアのインストール(PLINK)
動画視聴
(45分)
確認テスト
5,000円
R ・Rの概要、基本的な操作方法
・演算、変数と代入、データ型とデータ構造
・作図のサンプルコマンド紹介、パッケージインストール
動画視聴
(32分)
GWAS ・GWASの概要と論文事例、SNPアレイ解析
・ケースコントロール解析と量的形質関連解析
・SNPインピュテーション、PRS解析
動画視聴
(63分)
5,000円

<オンデマンド実習プラン>

科目 学習内容 学習方式 価格(税抜)
Linux エッセンシャル動画視聴プランの内容に加えて
・アクセス権限変更等の追加10コマンド紹介と実習
・BLAST、Samtoolsのインストール
・動画視聴(48分)
・サーバ実習(33問)
・ハンズオン質問会
60,000円
R エッセンシャル動画視聴プランの内容に加えて
・各データ構造の各種関数、基本統計量の解説と実習
・箱ひげ図、ヒストグラム、散布図等の解説と実習
・カテゴリ単位の処理、スクリプトファイル読込
・動画視聴(74分)
・サーバ実習(34問)
・ハンズオン質問会
60,000円
RNA-seq 【発現変動遺伝子の検出、二群間比較】
・QCからGO・パスウェイエンリッチメント解析
 までの実践的な実習
・動画視聴(74分)
・公開データ解析実習
・ハンズオン質問会
80,000円
シングルセル
RNA-seq
【Seurat】
【Seuratを用いたシングルセルRNA-seq解析技術】
・クラスタリングやマーカー遺伝子探索と
 セルタイプ同定などの実践的な実習
・動画視聴(60分)
・公開データ解析実習
・ハンズオン質問会
100,000円
シングルセル
RNA-seq
発展
【擬似系譜解析とvelocity解析】
・monocleを用いたtrajectory解析の解説と実習
・velocytoを用いたRNA velocity解析の解説と実習
・動画視聴(58分)
・公開データ解析実習
・ハンズオン質問会
100,000円
※学習期間(動画視聴・サーバ実習)は全プラン共通で2週間となります。

お客様の声

平日の昼間は忙しく、突発的なオペがあったりと学習時間を確保できなかったが、オンデマンド動画で日曜、祝日、夜間など自分の都合の良い時間に学習できた。

大学臨床研究医

臨床研究医
整備されたサーバ上でデータ解析を繰り返し実習でき、トライ&エラーで理解度が上がってよかった。事前学習でつまづいた部分もあったが、ハンズオン質問会で解決できた。

大学臨床研究医

国立研究所研究員
バイオインフォマティクス・トレーニングキャンペーン
新年度トレーニングキャンペーン

1科目目希望小売価格 8.0万円/名(税抜)

2科目目 半額 4.0万円/名(税抜)
※アカデミア限定、3名様でご受講の場合

この秋、私達のサービスをご愛顧いただいている皆様への感謝を込めて、全科目対象で2科目目半額(ご発注2科目ごとに2科目目が半額)となる「バイオインフォマティクス・トレーニングキャンペーン」を実施いたします。
是非、この機会にご検討ください。

対象期間 2024年9月9日(月)~11月29日(金)
キャンペーン対象 2科目以上のトレーニングをご発注された方(ご発注2科目ごとに2科目目が半額)
実施形式 オンライン
注意事項 訪問トレーニング、概論セミナーは対象外

特徴と対象科目

  • ・トレーニング受講形式は、平日に時間を確保できない方向けの「事前学習併用型」、豊富な応用科目からご選択いただける「同時双方向型」の2種類
  • ・トレーニング用サーバを利用しながら講義内容を実践
  • ・気軽に質問できる環境でつまずきを徹底サポート。基礎から実践まで一気にインプット
対象科目

「OPEN ▼」すると、トレーニング科目の詳細が表示されます。

基礎科目OPEN
Linux入門 学習目的多くの解析の基盤となるLinux操作技術を、バイオインフォマティクスに必要十分なレベルで習得
講義内容Windows, Macとは異なるOSのディレクトリ構造の理解、テキストファイル加工、ソフトウェアインストールなど
R入門 学習目的バイオインフォマティクス業界で頻繁に使われる統計ソフト Rの操作技術習得
講義内容Rの基本的な操作方法、作図、解析目的に応じた公開パッケージのインストール・使用方法など
Python入門 学習目的バイオインフォマティクスに最適化したPythonプログラミングの基本を習得
講義内容Python3系によるプログラミングの基礎知識から、モジュールのインポート、簡単な自作プログラムのコーディングまで
シェルスクリプト
入門
学習目的Linux環境を用いた解析の代表的自動化手法であるシェルスクリプトの基本を習得
講義内容シェルスクリプトの基礎知識から、FastQCなどの解析コマンド自動化スクリプト作成まで
応用科目OPEN
RNA-seq解析 学習目的RNA-seq解析による発現変動遺伝子の検出、二群間比較の習得
講義内容公開シーケンスデータを用いたオープンソースソフトウエアによる、QCからGO・パスウェイエンリッチメント解析までの実践的な実習
シングルセル
RNA-seq解析
【Seurat】
学習目的Seuratを用いたシングルセルRNA-seq解析技術を習得
講義内容公開シーケンスデータを用いたオープンソースソフトウエアによる、クラスタリングやマーカー遺伝子探索とセルタイプ同定などの実践的な実習
シングルセル
RNA-seq解析
発展
学習目的シングルセルRNA-seq解析の擬似系譜解析とvelocity解析を習得
講義内容公開シーケンスデータを用いたオープンソースソフトウエアによる、疑似系譜解析・RNA velocity解析の実践的な実習
がん変異解析 学習目的ゲノム医療におけるスタンダードな解析手法の習得
講義内容公開シーケンスデータを用いたオープンソースソフトウエアによる、体細胞変異検出からoncoplot等を用いた変異情報の可視化までの実践的な実習
遺伝性変異解析 学習目的WGS・WESの遺伝性変異解析による遺伝子変異・多型解析技術の習得
講義内容公開シーケンスデータを用いたオープンソースソフトウエアによる、germline変異の検出・フィルタリング・アノテーションなどの実践的な実習
マイクロアレイを
用いた
発現解析
学習目的Rによるマイクロアレイを用いた発現解析技術の習得
講義内容公開データを用いたオープンソースソフトウエアによる、アレイデータの正規化、発現変動解析、クラスタリング、ヒートマップ作図などの実践的な実習
ゲノムワイド
関連解析
(GWAS)
学習目的case, controlのSNPアレイデータを用いたゲノムワイド関連解析(GWAS)技術の習得
講義内容公開データを用いたPLINK、Rによる、case-control関連解析やアノテーション、層別解析などの実践的な実習
メタゲノム解析 学習目的QIIME2を用いたメタゲノム解析技術を習得
講義内容公開シーケンスデータを用いたオープンソースソフトウエアによる、系統樹作成やTaxon分類、多様性解析などの実践的な実習
ATAC-seq解析 学習目的ATAC-seq解析技術の習得
講義内容公開シーケンスデータを用いたオープンソースソフトウエアによる、QCからピークアノテーション、モチーフ探索までの実践的な実習
ChIP-seq解析 学習目的ChIP-seq解析技術の習得
講義内容公開シーケンスデータを用いたオープンソースソフトウエアによる、QCからピークアノテーション、モチーフ探索までの実践的な実習
CUT&RUN-seq解析 学習目的CUT&RUN-seq解析技術の習得
講義内容公開シーケンスデータを用いたオープンソースソフトウエアによる、QCからピークアノテーション、モチーフ探索までの実践的な実習

おすすめの科目構成

  • シングルセルRNA-seqを始めたい
    基礎科目:Linux入門、R入門
    応用科目:シングルセルRNA-seq解析【Seurat】、シングルセルRNA-seq解析・発展
  • RNA-seqを始めたい
    基礎科目:Linux入門、R入門
    応用科目:RNA-seq解析

お客様の声

事前学習期間中に自分のペースで、理解度の浅いところなど重点的に学習できた。また、整備されたサーバ上でデータ解析を繰り返し実習でき、トライ&エラーで理解度が上がってよかった。事前学習でつまづいた部分もあったが、ハンズオン質問会で解決できた。

大学臨床研究医(事前学習併用型トレーニング受講)

臨床研究医
普段からRを少し触っているが、しっかり学ぶ機会はこれまでなかった。基礎から丁寧に教えていただき、実際にRNA-seq解析を実行できた。また、初歩的な質問も気軽にできる雰囲気で良かった。

国立研究所研究員(同時双方向型トレーニング受講)

国立研究所研究員
ハンズオン質問会ではデータ解析の単純な解説にとどまらず、妥当なパラメータ設定やどういう場合に役立つツールかなど実践を想定した疑問について、専門の方から有益なことを教えてもらえたので大変良かった。

国立研究所研究員(事前学習併用型トレーニング受講)

国立研究所研究員
新年度トレーニングキャンペーン
新年度トレーニングキャンペーン

基礎 1科目4.0万円/名(税抜)

応用 1科目6.8万円/名(税抜)
※アカデミア限定、3名様でご受講の場合

この春、新しい研究テーマに取り組むみなさまのバイオインフォマティクス技術習得を支援するため「新年度トレーニングキャンペーン」を実施いたします。解析サーバで解析を行うためのITインフラ領域の基礎科目と、実践的な課題解決の技術習得を目的とした応用科目を特別価格でご受講いただけます。

対象期間 2024年4月1日(月)~6月28日(金) ご発注まで
キャンペーン割引対象 Linux入門50%OFF、下記記載の応用科目20~10%OFF(受講人数に応じて)
実施形式 オンライン
注意事項 訪問トレーニング、概論セミナーは対象外。プログラミング領域は対象外

特徴と対象科目

  • ・データ解析を始めたいが、何から学べば良いかわからない
     ▶初心者の方でも体系的に学べるオンライントレーニングです
  • ・ゴールドスタンダードな解析手法を効率良く習得したい
     ▶弊社サーバーで実際にコマンドを入力しながら実習するので実践的なスキルが身につきます
  • ・バイオインフォマティクスに関する質問相手がいない
     ▶解析経験が豊富な講師にご質問いただけますので、実践的な知識を学ぶことができます
対象科目

「OPEN ▼」すると、トレーニング科目の詳細が表示されます。

基礎科目OPEN
Linux入門 学習目的多くの解析の基盤となるLinux操作技術を、バイオインフォマティクスに必要十分なレベルで習得
講義内容Windows, Macとは異なるOSのディレクトリ構造の理解、テキストファイル加工、ソフトウェアインストールなど
応用科目OPEN
RNA-seq解析 学習目的RNA-seq解析による発現変動遺伝子の検出、二群間比較の習得
講義内容公開シーケンスデータを用いたオープンソースソフトウエアによる、QCからGO・パスウェイエンリッチメント解析までの実践的な実習
マイクロアレイを
用いた
発現解析
学習目的Rによるマイクロアレイを用いた発現解析技術の習得
講義内容公開データを用いたオープンソースソフトウエアによる、アレイデータの正規化、発現変動解析、クラスタリング、ヒートマップ作図などの実践的な実習
遺伝性変異解析 学習目的WGS・WESの遺伝性変異解析による遺伝子変異・多型解析技術の習得
講義内容公開シーケンスデータを用いたオープンソースソフトウエアによる、germline変異の検出・フィルタリング・アノテーションなどの実践的な実習
ゲノムワイド
関連解析
(GWAS)
学習目的case, controlのSNPアレイデータを用いたゲノムワイド関連解析(GWAS)技術の習得
講義内容公開データを用いたPLINK、Rによる、case-control関連解析やアノテーション、層別解析などの実践的な実習
メタゲノム解析 学習目的QIIME2を用いたメタゲノム解析技術を習得
講義内容公開シーケンスデータを用いたオープンソースソフトウエアによる、系統樹作成やTaxon分類、多様性解析などの実践的な実習
ATAC-seq解析 学習目的ATAC-seq解析技術の習得
講義内容公開シーケンスデータを用いたオープンソースソフトウエアによる、QCからピークアノテーション、モチーフ探索までの実践的な実習
ChIP-seq解析 学習目的ChIP-seq解析技術の習得
講義内容公開シーケンスデータを用いたオープンソースソフトウエアによる、QCからピークアノテーション、モチーフ探索までの実践的な実習
CUT&RUN-seq解析 学習目的CUT&RUN-seq解析技術の習得
講義内容公開シーケンスデータを用いたオープンソースソフトウエアによる、QCからピークアノテーション、モチーフ探索までの実践的な実習

おすすめの科目構成

  • RNA-seqを始めたい
    基礎科目:Linux入門、R入門
    応用科目:RNA-seq
  • GWASを始めたい
    基礎科目:Linux入門
    応用科目:ゲノムワイド関連解析(GWAS)
※R入門、シングルセルRNA-seq、がん変異解析は本キャンペーンの対象外です。

お客様の声

事前学習期間中に自分のペースで、理解度の浅いところなど重点的に学習できた。また、整備されたサーバ上でデータ解析を繰り返し実習でき、トライ&エラーで理解度が上がってよかった。事前学習でつまづいた部分もあったが、ハンズオン質問会で解決できた。

大学臨床研究医(事前学習併用型トレーニング受講)

臨床研究医
普段からRを少し触っているが、しっかり学ぶ機会はこれまでなかった。基礎から丁寧に教えていただき、実際にRNA-seq解析を実行できた。また、初歩的な質問も気軽にできる雰囲気で良かった。

国立研究所研究員(同時双方向型トレーニング受講)

国立研究所研究員
ハンズオン質問会ではデータ解析の単純な解説にとどまらず、妥当なパラメータ設定やどういう場合に役立つツールかなど実践を想定した疑問について、専門の方から有益なことを教えてもらえたので大変良かった。

国立研究所研究員(事前学習併用型トレーニング受講)

国立研究所研究員
空間的遺伝子発現解析(Stereo-seq™)|WET&DRY解析【新年度受託解析キャンペーン】

空間的遺伝子発現解析(Stereo-seq™)WET&DRY解析【新年度受託解析キャンペーン】

論文作成には欠かせない
パスウェイ解析
擬似系譜解析

まで込みのスペシャルプライス

196万円/サンプル(税抜)
※1サンプルの場合の価格、
詳細は価格表をご参照ください

▼データ解析の専門家による報告会の様子をご覧ください▼

サービス内容

【WET】空間的遺伝子発現解析
○ Stereo-seq™ 技術(STOmics®)を用いた空間座標バーコーディングと遺伝子発現測定
○ MGI社 DNBSEQ-G400、またはT7によるシーケンシング(10-15M paired-end reads/検体)
【DRY】バイオインフォマティクス解析
○ 解析レポート、中間報告および最終報告(手法解説、結果解釈のディスカッション)
○ 発現定量解析(クオリティコントロール、正規化、データ統合、次元削減、クラスタリングおよびUMAP上の可視化・空間座標上の可視化、クラスタごとの特徴遺伝子の探索、着目遺伝子の発現量可視化(Feature plot, Violin plot)
○ サンプル間比較解析(各クラスタにおけるサンプル間発現比較解析、Gene Ontology解析、Reactomeパスウェイ解析)
○ 擬似系譜解析(Cell trajectoryの推定、Pseudotime の推定、着目遺伝子の発現パターン可視化)

データ解析内容

解析結果

サンプル要件 / 注意事項

サンプルタイプ:OCT凍結包埋新鮮組織

  • 生物種:ヒト、マウス(それ以外は要相談)
  • 組織溶解条件の確認
    • 凍結切片 (厚さ10μm) の作成と専用チップChip Pへのマウント
    • 別途切片3~5枚程度を凍結保管(RNA抽出して品質を確認)
  • 転写物解析用の実験
    • 凍結切片 (厚さ10μm) の作成と専用チップChip Tへのマウント

価格表(税抜)

製品名 価格
空間的遺伝子発現解析 (Stereo-seq)WET&DRY 1サンプル 196万円
2サンプル 340万円
(170万円/サンプル)
3サンプル 498万円
(166万円/サンプル)
4サンプル以上 580万円
(145万円/サンプル)
  • ※諸経費込みの総額費用

ご利用の流れ

ご利用の流れ(WET&DRY)

  • 研究目的、サンプル情報をヒアリングし、お見積りを作成します。
  • ご発注後、サンプルを準備いただき、シーケンスを行います。
  • 中間報告会にて、途中結果の報告および解析方針の確認、内容についてのディスカッションを行います。
  • 最終報告会にて、結果の報告および内容について、ご報告します。
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